Firma Atlantex Sp. z o.o. została założona w 1997r.

W tym samym roku spółka zakupiła trawler przetwórnię m/v Esther Gdy-154.
Mając na uwadze rozwój firmy i ekspansję połowową, z końcem 2002 roku trawler Esther Gdy-154 został sprzedany, a na jego miejsce spółka zakupiła w 2003r, większą jednostkę; trawler przetwórnię m/v Wiesbaden Gdy-157.  

Po raz kolejny flota Atlantexu powiększyła się w roku 2005, kiedy to został zakupiony trawler do połowów gatunków pelagicznych m/v Anders Gdy-38.

W latach 1997-2008 statki Atlantexu prowadziły działalność połowową na Atlantyku Północnym (NEAFC, NAFO, Morze Północne).

W roku 2008, spółka Atlantex przeprowadziła gruntowną restrukturyzację swojego nakładu połowowego.

Jeszcze w 2007 roku został sprzedany m/v Anders Gdy-38, a w 2008 wycofany z eksploatacji został m/v Wiesbaden Gdy-157.

Na ich miejsce, spólka zakupiła dwa duże trawlery przetwórnie klasy Vigo- m/v Alinę Gdy-46 oraz m/v Anders Gdy-39 (odziedziczył on imie po swoim poprzedniku).

W 2009 roku, statek Anders Gdy-39 został zastąpiony trawlerem Sirius Gdy-43, bliźniaczą jednostką m/v Aliny Gdy-46.

Od 2008 roku, statki Atlantexu poławiają głównie na łowiskach Afryki Zachodniej ( Maroko i Maureatnia), oraz na Pacyfiku Południowym (SPRFMO).